某支行营业部2006年2月2日协助人民法院冻结开户单位华威公司存款400000元，当时账户余额5839元，支行采取只收不付方式冻结，6月30日，该单位大额支付系统入帐500000元，由于该单位在支行有笔300000元贷款即将逾期且有表内欠息12367元，经办人员将单位来款事宜通知客户经理部，为完成上半年利润计划以及还贷收息计划，客户经理部请示支行行长同意后，通知客户提交归还贷款手续，通知支行营业部为该单位办理撤销冻结手续，并归还了该笔贷款和欠息，随后重新对账户进行了冻结处理。在办理解冻过程中，营业经理呈提出异议，后同意由行长签字后办理。请问：该支行业务处理过程中存在哪些问题？若该行对超出冻结额度部分扣款，应采取哪些步骤？